Materials Studio官方教程（Help-Tutorials）-使用分子晶体：研究尿素

简介：药品、农用化学品、颜料、染料、特种化学品和炸药在制造过程的某个阶段都是结晶材料。能够对此类结构进行建模可以扩展您对它们的理解，并最终帮助控制溶解度、保质期、形态、生物利用度、颜色、冲击敏感性、蒸气压和密度等特性。本练习中使用的尿素是分子结晶材料的一个简单示例。

目的：介绍材料可视化器(Materials Visualizer)中可用的晶体构建工具。

本教程重要节点：

打开分子晶体文件-计算氢键-调整晶体单元的显示范围-更改晶格显示样式-检查结构的氢键

1.打开分子晶体文件
选择File|Import…菜单栏中导入…。

导航到并选择Examples/Documents/3D Model/urea.msi，然后单击Open按钮。

显示包含尿素结晶相的一个晶胞的3D视图的窗口。名为urea.xsd的文档现在显示在Project Explorer中。请注意，文件扩展名已从.msi更改为.xsd。

2.计算氢键
菜单栏中选择Build|Hydrogen Bonds。

这将打开氢键计算对话框。请注意，您可以应用许多不同的方案和键几何参数来计算氢键或创建和保存自己的方案。

出于本示例的目的，保留默认值并单击Calculate按钮。氢键在晶胞中显示为蓝色虚线。

注意：也可以通过工具栏上Atoms&Bonds的计算氢键按钮

来进行氢键计算。单击关闭按钮关闭氢键计算对话框。

3.调整晶体单元的显示范围
在3D Viewer中单击鼠标右键，然后从快捷菜单中选择Display Style。

这将打开显示样式对话框。

选择“显示样式”对话框上的Lattice选项卡以显示用于更改点阵显示样式的选项。在Display style部分中，将A行中的Max更改为2.00。对B和C行中的Max执行相同操作。

显示样式控件提供了显示用户定义的单元格范围和数量的选项，包括输入单元格长度分数的能力。你现在应该有一个2×2×2的尿素晶格，可以更清楚地显示氢键方案。

4.更改晶格显示样式
在Lattice部分中，选择none，单击Close按钮关闭显示样式对话框。

5.检查结构的氢键
旋转视图以研究氢键网格。为了帮助您清楚地看到氢键，请单击3D Viewer工具栏上的Reset View按钮重置视图。

使用up,down,right,andleft箭头键以45°为增量旋转模型。

教程到此结束。